学术主张
陆世仪学问广博，天文地理、礼乐农桑、河渠贡赋，战阵刑法，无所不通，又精技击，早年曾拜被誉为“江南第一”的名师石敬岩学习枪法，研习兵法，作《八阵发明》图说，深得顾炎武赞许。目睹娄江水患，又钻研水利，撰写《淘河议》、《决排脱》、《建闸议》，用于治水。
理学宗朱程，反对王守仁的“致良知”，他说：“致良知虽是直截，终不赅括，不如穷理稳当。……天下事有可以不虑而知者，心性道德是也。有必待学而知者，名物度数是也。假如只天文一事，亦儒者所当知，然其星辰次舍，七政运行，必观书考图，然后明白，纯靠良知，致得去否？”他的学说以“居敬穷理”为本，着重内心修养，主张读书要讲求实用。认为除“六艺”外，天问、地理、河渠、兵法之类，都是安国兴邦不可缺少的有用知识。他认为朝廷用人要大破成格，不拘资地，他鼓励青年要有“体用具备，文武兼资”的才干，以救亡图强，振兴国家。
他的实学思想，在明清之际影响了一代学人。由于陆世仪思想体系中对西方科技持开放态度，具有近代启蒙意义，因此被中国思想研究中心列为从孔子到孙中山，对中国思想进程有重大影响的思想家之一。
陆世仪的诗文
野水滩头长荻芽，池塘处处起鸣蛙。一春多雨占三白，二月无茶摘五加。
寒食沓来惊汉腊，塞歌时起接边笳。春郊风景还如旧，添得伤心是短髽。
墙角春风吹棣棠，菜花香里豆花香。看鱼独立小池影，数笋闲行竹筱长。
白眼望天非是醉，科头混俗若为狂。莫嫌世外人疏放，彭泽情深胜沅湘。
十年蹈海一身轻，故国重回代已更。梦里鲸波如昨日，尊前鲑菜只平生。
乾坤何处容孤往，丘壑吾侪且耦耕。遁世工夫正无限，可能相助一经营。
一夜东风春雨赊，起看流水入沟斜。篱头未下丝瓜种，墙脚先开蚕豆花。
稚子凿池浮乳鸭，老翁摊箔晒新暇。已知身世无余乐，聊尔徜徉未是差。
仲冬霜雪降，寒月光逾凉。独夜起徘徊，矫首中庭望。
三垣何闇汶，列宿纵横行。天狼射丸丸，舒光异平常。
旄头当天明，弧矢驰不张。天道不可知，叹息徒徬徨。
仲尼千载师，偃蹇生衰周。孟轲谈王道，七雄非其俦。
濂洛关闽儒，学至君未求。晦翁振绝续，南渡时蒙羞。
嗟嗟鲁斋公，仕元以为尤。岂天靳斯文，每出多邅遛。
展卷仰前哲，浩然忘我忧。
石斋先生天下师，君能弱冠长揖之。著书如风腕欲脱，吐论凿凿称雄奇。
石斋为君亦拱手，略尽形骸呼小友。赠君药言送君诗，直欲与君分半亩。
天公天公何不仁，忠臣饿死英雄贫。岭云如山战骨白，至今闽海飞征尘。
男儿致身苦不早，双鬓蹉跎浑欲老。安能局促辕下驹，凤凰翱翔在苍昊。
束书蹑屩作壮游，志气直欲凌九州。扁舟千里入吴会，上书论古惊同俦。
腐儒如予那足道，感君意气为倾倒。挥毫赠我琅玕辞，愧乏琼瑶无以报。
君今策蹇问中原，山川漫漫道路昏。胡琴欲碎向何处，夜半起舞心烦冤。
金陵城中王气尽，蒋山断树生芝菌。日落江潮惨不波，维扬明月歌春蚓。
君不见昔日江东祖士雅，击楫中流泪盈把。又不见辽东皂帽翁，语维经典甘孤穷。
丈夫处世只两途，吾子坎壈将安终。中原人才颇不恶，风尘往往倾然诺。
昂藏七尺未长贫，暗中定可相摸索。归来好复过桴亭，西窗剪烛开短屏。
交知四海见吾子，相对使人双眼青。
春社才过雨水中，灌园初学问山翁。新成芥辣旋栽苣，既落瓜壶不用葱。
衣履已知非晋代，蚕桑聊自说《豳风》。高原小麦青青秀，不见歌声起故宫。
潜鱼怀深渊，飞鸟慕青冥。志尚各有适，罗弋纷四陈。
神龙失云雾，蠖伏同众鳞。哲士无势位，俯首齐凡民。
仰叹发浩歌，悲来痛填膺。气数苟在天，匹夫岂能争。
时予避地水村，土人乱，复入城。仲雍避荆吴，断发文其身。
殷箕遘昏乱，佯狂受奴髡。少连柳下惠，降辱称逸民。
微服过宋都，去衣入裸人。在昔大圣哲，处困皆有伦。
区区卑贱子，含垢安足嗔。伏读明夷卦，悠然感我心。
柔顺以蒙难，艰贞晦其明。踬马恒破车，恶妇恒破家。
冠帻事攻劫，安能正奇邪。汉家四百载，党祸为萌芽。
处士盛名节，朝廷非所嘉。名节尚不可，何况群骄奢。
营头夜陨海涛奔，真宰茫茫未可论。绝岛君臣留正朔，瘴天风雨葬忠魂。
谁将心事传龙比，赖有遗书属弟昆。千古崖山成恨事，临风遥恸一倾樽。